岗位介绍
该职位隶属于卡罗琳斯卡医学院索尔纳校区生物医学系MTC的Ben Murrell团队。该实验室致力于实验/计算跨学科研究，涉及病毒学和免疫学等主题，目前专注于计算生物学，专注于开发用于蛋白质序列和结构的深度学习方法及应用，以及系统发育学等主题。该项目将与实验人员密切合作，并由病毒学和免疫学领域的专家Gerald McInerney教授和Daniel Sheward博士共同指导。
For a recent list of topics that the Murrell lab works on, please see:
https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=I80vy5cAAAAJ&sortby=pubdate
https://staff.ki.se/people/benjamin-murrell
博士生项目和博士生职责
本数据驱动生命科学 (DDLS) 博士项目专注于蛋白质结构的概率模型，该模型主要用于计算蛋白质设计，也可用于一系列与建模和理解蛋白质及其行为相关的其他应用。该项目的核心是开发和完善新的计算方法和模型，包括扩展实验室中已在开发的方法，并特别关注如何对蛋白质设计进行更精确的控制。
该项目还将与联合导师及其实验室合作，探讨这些方法（以及其他研究人员开发的方法）在感染生物学中的应用，主要用于设计新疫苗的免疫原，同时也探索其他应用。另一个目标是利用我们正在开发的一些方法所特有的特性，尝试改进次要模型用例，例如评估设计的骨架和预测蛋白质变体的功能效应。
此外，博士生将成为 DDLS 计划的一部分，并参加 DDLS 研究学院。
我们提供什么？
充满创造力和启发性的环境，充满专业知识和好奇心。卡罗琳斯卡医学院是世界领先的医学院之一。我们的愿景是拓展生命知识，促进全民健康。在卡罗琳斯卡医学院，我们开展卓有成效的医学研究，并拥有瑞典规模最大的医学教育。作为博士生，您将获得个人研究项目、一位受过良好教育的导师、丰富的选修课程以及在顶尖研究团队工作的机会。卡罗琳斯卡医学院与世界各地的知名大学合作，确保国际交流机会。您将获得博士生奖学金，这意味着您将获得合同工资。员工还可以免费使用我们现代化的健身房，并获得医疗费用报销。
岗位要求
技能和个人素质
除上述职位要求外，还需满足以下条件：
需要具有可证明的计算能力，能够熟练使用和开发算法、数据结构等来解决具有挑战性的问题（招聘期间将进行实际编码评估）
需要扎实的数学基础（多元微积分、线性代数、概率论等）
需要具备与数学、统计学、物理学、计算机科学或工程学学位相当的定量主题能力（如果您的学位不属于这些领域之一，则需要证明您已经获得了这种水平的能力）
需要强烈的动机来开发新的计算方法，详细探究其行为并将其应用于生物学挑战。
需要一定程度的概率建模和/或深度学习的经验和理解，并希望加深这种理解。
候选人必须表现出独立工作的意愿和强大的沟通能力，以便与团队合作。
任职有功：
具有深度学习模型开发和/或实施经验者优先（特别是在蛋白质结构的背景下）
具有结构生物学和/或分子动力学经验者优先
公开代码是有利的
具有 Julia 编程语言经验者优先